Ngày 5 tháng 2 năm 2017, hàng nghìn người đã về bến sông trước cửa đình làng Bát Tràng để tham dự lễ phóng sinh do Thượng tọa Thích Chân Quang chủ trì, tại buổi lễ này nhiều tấn cá, trong đó có cá chim trắng được thả phóng sinh.[13][14] Loài cá chim trắng đó có các danh pháp là Colossoma brachypomum, Piaractus brachypomus và là loài ngoại lai có nguy cơ xâm hại.[15][16][17] Tuy nhiên loài này được Bộ Thủy sản liệt kê vào danh mục giống thủy sản nước ngọt được phép nhập khẩu thông thường từ năm 2001[18][19] và có tên trong Danh mục giống thuỷ sản được phép sản xuất, kinh doanh.[20]

Năm 2021, clip các tu sĩ tại chùa Phật Quang (do Thượng tọa Thích Chân Quang trụ trì) nuốt giun đất được phát tán trên mạng. Ban Thường trực Ban Trị sự tỉnh Bà Rịa - Vũng Tàu đã đề nghị Thích Chân Quang có tờ trình về cách giải quyết vụ việc này.[21]

Luận án tiến sĩ của Thích Chân Quang nhận được nhiều đánh giá khác nhau. Giáo sư Hoàng Chí Bảo, nguyên Ủy viên Hội đồng lý luận Trung ương, cho rằng luận án này là sự đột phá, có những sự phá cách trong quá trình bảo vệ Luận án.[22] Ở chiều ngược lại, Nguyễn Quốc Tấn Trung không đồng tình với quan điểm của nhà sư trong luận án, cho rằng "phúc lợi là thứ có thể đánh đổi bằng nghĩa vụ được, nhưng mà nhân quyền là thứ hoàn toàn khác, không thể đánh đổi bằng nghĩa vụ".[23]

Ngoài ra, ông Thích Chân Quang cũng từng có nhiều câu nói gây tranh cãi khi thuyết giảng pháp như "Trung Quốc là anh, Việt Nam là em", "cái võng là nơi tiêu diệt hết công đức của chúng sinh"…[24][25]